فیلتر کربن بیشتر در سیستم‌های فیلتراسیون آب آکواریوم کاربرد دارد. این فیلتر با جذب عناصر اضافی در آب، در بهبود کیفیت فیزیکی و شیمیایی آب ایفای نقش می‌کند.
کاهش بو و طعم آب، فیلتر جامدات در حد میکرون و حذف دارو و مواد شیمیایی از موارد کاربردی فیلترهای کربن در سیستم فیلتراسیون سازه‌های آکواریومی و صنعتی هستند.